Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smyd3Q9CWR2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms