Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sycp2Q9CUU3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms