Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d3Q9CSV6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d3Q9CSV6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms