Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkiras2Q9CR56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkiras2Q9CR56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms