Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PclafQ9CQX4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PclafQ9CQX4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PclafQ9CQX4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PclafQ9CQX4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PclafQ9CQX4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms