Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CQ90 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CQ90 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQ90 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQ90 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms