Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acss1Q99NB1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms