Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PccbQ99MN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PccbQ99MN9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms