Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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PtprtQ99M80 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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PtprtQ99M80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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PtprtQ99M80 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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PtprtQ99M80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
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PtprtQ99M80 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprtQ99M80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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PtprtQ99M80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PtprtQ99M80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms