Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epdr1Q99M71 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms