Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gins4Q99LZ3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms