Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Reep3Q99KK1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms