Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcf19Q99KJ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcf19Q99KJ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms