Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn2aQ99KJ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms