Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lims1Q99JW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms