Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms