Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf3Q920N1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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