Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps36Q91XD6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps36Q91XD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms