Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc42ep1Q91W92 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep1Q91W92 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms