Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csde1Q91W50 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Csde1Q91W50 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csde1Q91W50 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms