Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cabp4Q8VHC5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cabp4Q8VHC5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms