Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrkQ8VDU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnrkQ8VDU5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms