Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med17Q8VCD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms