Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2W9

Pank3, Pantothenate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank3Q8R2W9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pank3Q8R2W9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pank3Q8R2W9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms