Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TprkbQ8QZZ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TprkbQ8QZZ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms