Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b4Q8QZY9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b4Q8QZY9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms