Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh16f2Q8K3M1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms