Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MyripQ8K3I4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms