Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncapd2Q8K2Z4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncapd2Q8K2Z4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms