Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stn1Q8K2X3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms