Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcf3Q8K268 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Abcf3Q8K268 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Abcf3Q8K268 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Abcf3Q8K268 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcf3Q8K268 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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