Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spire2Q8K1S6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spire2Q8K1S6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms