Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Tbc1d23Q8K0F1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbc1d23Q8K0F1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tbc1d23Q8K0F1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Tbc1d23Q8K0F1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms