Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CopaQ8CIE6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CopaQ8CIE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms