Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Upp2Q8CGR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms