Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc9Q8CDN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc9Q8CDN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc9Q8CDN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc9Q8CDN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms