Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riox2Q8CD15 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riox2Q8CD15 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms