Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ufl1Q8CCJ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms