Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrip1Q8CBD1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrip1Q8CBD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nrip1Q8CBD1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms