Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E130116L18RikQ8BMV6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms