Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo1Q8BFY9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnpo1Q8BFY9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnpo1Q8BFY9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms