Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg4cQ811C2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms