Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amigo1Q80ZD8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amigo1Q80ZD8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms