Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm5bQ80Y84 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5bQ80Y84 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5bQ80Y84 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms