Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clasp1Q80TV8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clasp1Q80TV8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clasp1Q80TV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms