Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnf1Q7TSH7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms