Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc93Q7TQK5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms