Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rpf1Q7TND5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms