Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms