Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup188Q6ZQH8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup188Q6ZQH8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup188Q6ZQH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms